北京新亚学校在2025年学费分层设置为，​小学部：综合素质班8.8万/年，剑桥双语班12.8万/年；​初中部：11.8万/年；高中部：普通班12.8万/年，小语种高考班14.8万/年。住宿费统一为2.5万/学年，宿舍为4人间，配备独立卫浴、空调及新风系统。餐费按实际消费计算（约75元/天），校车线路覆盖朝阳区主要地铁站。